第1章 戦士集結
これでは、強化人間以下じゃないか! 〜アムロ〜
 チュートリアル的なステージなので問題はないでしょう。 小隊の編成やゲームの流れを覚えたり、色々なキャラを隊長にして各キャラの性質を感じ取りましょう。 使えない武器もありますが成長すれば使えるようになります。 注意するのはホーラとゲラバ、そしてギャブレ―ぐらい。 この場合ジロンとダバで戦闘を行うとセリフがあります。 これ以降も原作が同じキャラで戦闘を行うように心がけましょう。 オススメとしては最も速く行動できるショウを隊長にすると使いやすいです。 なお、母艦で敵小隊に破れるとゲームオーバーなのでこまめにセーブしすぎるとハマル可能性があるので注意。
第2章 セントール始動!
しょせんオレたちは、ここじゃ異邦人さ! 正義だのなんだの関係ないぜ! 〜トッド〜
 このステージから本格的な戦闘になり、またアップルを使った成長、補給値を使った機体改造も出来るようになります。 注意点としてアップルは今後、大量に入手できるので惜しみなく使っても大丈夫ですが、 補給値は全体を通して15000ほどしか手に入りません。 ちなみに一機フル改造すには補給値が約9000必要です。稼げるステージはありますが後に説明。 話しを戦術に戻しますと、まずは小隊を派遣して進撃していくのですが ある程度進むと伏兵としてトッドとグレタが登場します。 この時、母艦の守りが一体だとかなり危険なので母艦の”帰還”を使うとよいでしょう。 こだわりキャラは説明不要と思います。 この二人を倒すと後は問題がないのですが、母艦の後ろにバーン、ネイ、ティンプが出現します。 しかし、この三人は動かないのでまずは下の敵ポイントを攻略して補給値を稼いでおきましょう。 その後の展開は艦で待ち構えておけば問題なし。
第3章 王都の攻防
エレノアという女性に感謝することだな。彼女の真意が、貴様たちを見逃してくれたのだ。 〜シャア〜
 特に目立った敵もおらず敵の数がいささか多いが母艦で迎え撃てば問題なし。 戦闘を楽しみたい! て人は小隊を派遣して各マップで戦術を研究するのもよいでしょう(母艦の守りは常に気を配ること)。 ここではカミーユが顔見せ程度で助けに来てくれます。 この時、敵第一波を殲滅する部隊の隊長機の改造レベルが0だとZガンダムが早期成長。 あと、戦艦を落とす前に脇の雑魚を倒して補給値を稼いでおきましょう。
第4章 新たな旅立ち
アーク少尉……君が艦長をやることに反対する者など、ここにはおらんよ。 〜テヴィエ〜
 開始早々敵小隊が進撃してくるが、一体づつの小隊なので母艦で迎え撃ちつつ下の三つのポイントを落して補給値を稼いでおこう。 このポイントは第一波を全滅させると消えるので早めに小隊を派遣しておくのが吉。 気をつける相手として、ヤザンとガラリア。またこの面からジロン、ダバ、ショウは機体を乗り換え。 メンバーも増えるが女性陣は戦力的に心もとないので男性メンバーと組ませるのがよい。
第5章 氷原の追跡
……こうなったら、何としてでも皇女はお守りする!! 命にかえても……だ!! 〜ギャブレ―〜
 かなり楽勝なステージなのでイベントを楽しみましょう。 注意としてはギャブレ―の乗るグルーンが強力なことくらい。 戦闘終了後カミーユとフォウのイベントがあり、サイコガンダムと戦うがやられなければOK。 動くサイコガンダムはなかなか迫力がある。必見!
第6章 燃えるワトホート
あいつは、あたしたちを使い捨ての道具にしか考えてないんだよ! 〜ネイ〜
 敵の数も多くブランチ戦士も多数登場。 基本的に母艦にて待ち構えるのが得策ですが、仲間の数も多いのでこだわりキャラで小隊を編成して打って出るのもよい。
第7章 ギャブレ―遊撃隊
義に死してこそ華だとは、思わんか! 〜ギャブレー〜
 基本的にエルガイムがらみのお話。注意すべきはマクトミンとアシュラテンプルに乗るギャブレーぐらい。 マップが狭いので敵と連戦になるが問題はないと思うので、こだわりキャラのセリフを楽しもう。 そして、このステージの最後に特別なマップがある。 湖に向かう際、三つのルートの内一番先に左の道を進むとザンボット3を入手できる。 また、ここでは女性陣だけでグレタ、ガラリア組と戦わなければいけませんが、負けても話しは進むので心配なく。 倒したいなら成長・強化必須。
第8章 決戦の海
流れているのはブランチの血だけだ! こいつはオレ達の生き残り戦争なんだぜ! 〜ジェリド〜
 前ステージでザンボットを仲間にしていると開始時にちょっとしたイベントがあります。 また、このステージでは補給値を時間はかかりますが稼ぐことが出来ます。 方法は初期配置のミサイル発射基地を全て壊さないでおく。これで敵の小隊が無限に出てきます。 この小隊を倒し続ければ補給値は溜まっていますが9999を超えるポイントは切り捨てられるので注意。 最後はビグ・ザムと戦闘がありますが、その前にドラグーンを落すとダイターン3が手に入ります。 ビグ・ザムはかなり強いので心配なら母艦に到達する前に小隊を派遣して撃破しましょう。
第9章 ウルスの影
私達は、ブランチの血のために虐待を受けておりました。 〜エレノア〜
前のステージで補給値を稼いでいれば楽勝。前半すぐにイベントが起きるので逃げる敵小隊は早めに全滅させておきたい。 後半は少々厄介な相手が登場。中でもクェスとギュネイはかなり強いので注意が必要。 こだわりキャラはアムロ、カミーユですがこのふたりだけだとちょっとキツイです。 後はジェリル辺りにも注意が必要、いざとなれば二大無敵ロボを使おう。
第10章 終わりなき死闘
お別れだショウ! 地獄で待ってるぜ…… 〜トッド〜
最終面手前の為に長めの話。ここでも補給値を稼ぐことが出来るが、敵が結構強いので油断してゲームオーバにならないように。 最も苦戦するのはハイパー化したトッドだが、ヤザンのハンブラビは三回攻撃を行うので注意。 なお増援はシャトル発射施設を破壊しない限り続き、ひとつでも破壊するとクリアとなる。 ジェリルはハイパー化しないので心配なく。
第11章 理想の惑星
シャア…シャア・アズナブル!! 私の命を…私の命を吸ってください…! 〜エレノア〜
いよいよ最終面なだが、こちらに攻めてくる敵はいないのでゆっくり進めることが出来る。 外周のポイントを落すと新たなルートが開き内側に入れるようになる。ここではティンプ、ネイ、バーンがいるが全員倒す必要はない(位置で言えばティンプ以外を倒すとシャアへの道が開く)。 この三人を倒すのなら、それぞれのこだわりキャラを派遣しましょう。 最後はシャアとエレノアのWサザビーを戦うのだが、実はエレノアのサザビーは兵装少なく落しやすくなっている。 またエレノアはカミーユとなぜか会話があるので見ておくように。 この二人を倒すとエレノアの命でシャアのサザビーがハイパー化して”ハイパーサザビー”になる(いくらなんでもやりすぎな気もするが)。 この時シャアのレベルは99になるのですが、この状態のファンネル攻撃は計算上クリティカル率が100%を超える。 攻略本には背後から攻撃すればファンネルを破壊すること出来るらしいが、私は壊せたことがありません。 最後にハイパーシャアは全キャラとの会話があるので色々なパターンを試してみよう。
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